Resumen:
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Los ecosistemas dulceacuícolas mantienen alrededor del 12% de la fauna animal del planeta. El estudio de las relaciones filogenéticas, a través de marcadores moleculares, de las especies permite inferir los procesos históricos, tanto geológicos como climáticos, y sus efectos en la biodiversidad. Por tanto, los estudios en biología evolutiva proveen información esencial para comprender los cambios pasados y futuros en la ictiofauna continental y sus hábitats. Esta tesis doctoral tiene como objetivo general el aplicar técnicas moleculares para responder a diversas preguntas en biología evolutiva de peces continentales. Concretamente: a) la descripción de la historia evolutiva de tres complejos de especies de peces continentales de México y la Península Ibérica; b) un estudio macroevolutivo sobre la evolución del viviparismo en el orden Cyprinodontiformes y los cambios estructurales y funcionales asociados al origen de esta novedad evolutiva; c) aportar nuevos criterios para la selección de marcadores mitocondriales para futuros estudios filogenéticos y d) describir nuevos genomas mitocondriales. Esta tesis comprende un conjunto de estudios realizados entre Octubre de 2013 y Marzo del 2017. Tres complejos de especies fueron estudiados que presentan peculiaridades evolutivas, estrechas relaciones filogenéticas y taxonomía incierta. De México, se estudió el complejo de especies vivíparas Allotoca diazi, y el complejo de especies tetraploides Catostomus plebeius-nebuliferus. De la Península Ibérica, el nuevo complejo de origen hibridogenético Squalius sp. Para ello se utilizaron distintos marcadores moleculares tanto mitocondriales como nucleares, desde genes que pueden resolver relaciones interespecíficas, hasta regiones hipervariables como microsatélites que puedes dar información a nivel de poblaciones e inclusive de individuos. La información genética se integró con herramientas analíticas para describir patrones demográficos, de diversidad genética, estimar tiempos de divergencia, reconstruir áreas ancestrales, y modelizar el nicho ecológico. Finalmente, se aportaron criterios para la conservación para cada uno de los complejos de especies estudiados...
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